Il est maintenant bien établi que les changements climatiques combinés aux pressions anthropiques entraînent de profondes modifications sur les écosystèmes marins côtiers et l’état de santé des populations qu’on y retrouvent. Ces répercussions sont particulièrement accentuées dans les milieux polaires. Ces effets impactent sur la biodiversité, l’abondance et la répartition géographiques des populations d’espèces marines intertidales. C’est notamment le cas chez les espèces sentinelles et celles faisant partie des aliments traditionnels inuits, comme la moule bleue (Mytilus spp.). Malgré des avancées considérables dans les méthodes de suivi de l’état de santé de ces espèces, nos connaissances sur l’ensemble de la flore bactérienne et virale et leur sensibilité aux pressions anthropiques demeurent fragmentaires. Cette problématique est amplifiée par les conditions difficiles et les coûts élevés associés aux logistiques d’échantillonnage en milieu polaire. Afin de surmonter ces obstacles, nous proposons de combiner les avancées récentes dans le domaine biomédical afin d’établir une nouvelle plateforme d’échantillonnage qui exploite le concept de biopsies liquides afin de faciliter le monitoring de l’état de santé des écosystèmes côtiers en milieu polaire. Chez l’humain, le concept de biopsies liquides est un domaine en plein émergence. Basé sur les approches de séquençage à haut débit de l’ADN libre circulant dans le plasma et sur des méthodes noninvasives et logistiquement simples, il permet de détecter et de mesurer avec une grande sensibilité et précision l’effet de différentes formes de stress physiques, chimiques ou biologiques sur un individu, et ce à partir d’une simple goutte de sang. L’objectif général de notre programme vise à exploiter cette approche afin d’établir des hypothèses sur la dynamique spatiotemporelle des différentes signatures permettant de mettre en évidence des dysbioses virales et bactériennes chez la moule bleue.


UVILUQ: A platform for the use of liquid biopsies to monitor the health of coastal marine ecosystems

It is now well established that climate change combined with anthropogenic pressures are causing profound changes to coastal marine ecosystems and the health of their populations. These impacts are particularly pronounced in polar environments. These effects impact the biodiversity, abundance and geographic distribution of populations of intertidal marine species. This is particularly the case for sentinel species and those that are part of traditional Inuit foods, such as the blue mussel (Mytilus spp.). Despite considerable progress in methods for monitoring the health status of these species, our knowledge of the entire bacterial and viral flora and their sensitivity to anthropogenic pressures remains fragmentary. This problem is amplified by the difficult conditions and high costs associated with the logistics of sampling in polar environments. In order to overcome these obstacles, we propose to combine recent advances in the biomedical field to establish a new sampling platform that exploits the concept of liquid biopsies to facilitate the monitoring of the health of coastal ecosystems in polar environments. In humans, the concept of liquid biopsies is an emerging field. Based on high-throughput sequencing approaches of free DNA circulating in plasma and on non-invasive and logistically simple methods, it allows to detect and measure with great sensitivity and precision the effect of different forms of physical, chemical or biological stresses on an individual, from a single drop of blood. The general objective of our program is to exploit this approach in order to establish hypotheses on the spatiotemporal dynamics of the different signatures allowing to highlight viral and bacterial dysbiosis in the blue mussel.